Елена Малицкая начала свою работу в Сибирском центре в 1995 как финансовый менеджер. В этом качестве она стала одним из признанных экспертов в области финансового управления, налогообложения и бухгалтерского учета некоммерческих организаций. Основным достижением этого периода можно считать создание системы грантовой поддержки НКО Сибири российской межрегиональной организацией, организации взаимодействия членов Сибирской сети центров общественного развития, внедрение систем мониторинга и оценки в деятельность организации. С января 2002 года Президент МОФ СЦПОИ. Эксперт по вопросам государственной поддержки СО НКО, стратегическому управлению и организационному развитию, финансовому менеджменту, привлечению средств, взаимодействию с властью, работе в местных сообществах, развитию гражданского общества и его инфраструктуры. В 2017 году была Президентом Ассоциации Специалистов по Оценке Программ и Политик (Россия), является председателем комиссии ОП Новосибирской области по поддержке и развитию благотворительности, добровольчества и СО НКО.
